Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms