Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms