Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npdc1Q64322 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms