Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms