Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ScxQ64124 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ScxQ64124 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms