Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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