Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga6Q61739 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga6Q61739 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms