Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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PcolceQ61398 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PcolceQ61398 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PcolceQ61398 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PcolceQ61398 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PcolceQ61398 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcolceQ61398 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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