Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna2Q61301 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna2Q61301 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms