Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usf1Q61069 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usf1Q61069 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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