Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk1Q60855 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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