Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms