Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprnQ60673 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms