Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp20Q5XG71 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms