Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms