Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc6Q5U4D9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms