Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vmn1r196Q5SVD5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vmn1r196Q5SVD5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vmn1r196Q5SVD5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vmn1r196Q5SVD5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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