Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf12Q5SPL2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms