Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms