Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms