Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rtl5Q5DTT4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rtl5Q5DTT4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Rtl5Q5DTT4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Rtl5Q5DTT4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Rtl5Q5DTT4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Rtl5Q5DTT4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Rtl5Q5DTT4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Rtl5Q5DTT4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Rtl5Q5DTT4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Rtl5Q5DTT4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms