Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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