Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Snx25Q3ZT31 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx25Q3ZT31 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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