Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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