Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms