Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms