Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms