Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms