Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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