Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms