Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip13Q3UA06 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms