Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms