Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gse1Q3U3C9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms