Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Hvcn1Q3U2S8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Hvcn1Q3U2S8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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Hvcn1Q3U2S8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms