Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud5Q3U2S4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud5Q3U2S4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud5Q3U2S4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms