Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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