Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms