Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5b1Q3TAP4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5b1Q3TAP4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5b1Q3TAP4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5b1Q3TAP4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5b1Q3TAP4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5b1Q3TAP4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms