Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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