Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vax1Q2NKI2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vax1Q2NKI2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vax1Q2NKI2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vax1Q2NKI2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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