Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms