Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd2Q149F1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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