Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms