Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms