Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms