Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CbfbQ08024 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms