Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp2Q06335 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp2Q06335 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms