Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms