Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox10Q04888 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms