Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox8Q04886 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms